Учёные представили VIRE, уникальную базу, которая объединяет около 1,7 миллиона вирусных геномов, полученных из более чем 100 000 метагеномных образцов со всей планеты. Эта база формируется при полном секвенировании ДНК из различных источников, включая морскую воду, почву и человеческий микробиом. Проект, возглавляемый Пиром Борком и Сугуро Нисидзимой, направлен на создание ресурса, который охватывает как медицинские, так и природные вирусные сообщества, отражая их разнообразие. VIRE, расшифровываемая как «Интегрированный ресурс вирусов в экосистемах», предоставляет данные, необходимые для изучения разнообразия вирусов и их влияния на микробные сообщества. Команда использовала современные алгоритмы для анализа генетического материала, что позволяет лучше понять экосистемные роли вирусов и их взаимодействие с организмами. Это исследование закладывает основу для глубокого изучения влияния вирусов на здоровье человека и экологию.
Вопрос-ответ
Что такое база данных VIRE?
VIRE, или «Интегрированный ресурс вирусов в экосистемах», — это уникальная база данных, которая содержит около 1,7 миллиона вирусных геномов. Эти геномы были собраны из более чем 100 000 метагеномных образцов, взятых из различных сред по всему миру, таких как морская вода, почва и микробиом человека.
Для чего была создана VIRE и какие задачи она решает?
Основная цель VIRE — предоставить учёным комплексный ресурс для изучения огромного разнообразия вирусов и их роли в экосистемах. База данных помогает исследовать, как вирусы влияют на микробные сообщества, их взаимодействие с другими организмами, а также их значение для экологии и здоровья человека.
Откуда были получены данные для этой базы?
Данные были получены путем полного секвенирования ДНК из метагеномных образцов. Эти образцы были собраны из самых разных источников по всей планете, что позволило охватить как природные (океаны, почва), так и медицинские (человеческий микробиом) вирусные сообщества.